В Казахстане Эмиль Кенжисариев появился в 18-летнем возрасте, когда его, лучшего полузащитника и лучшего футболиста Кыргызстана пригласила алматинская «Цесна», выступавшая в первой лиге. Дебют же в суперлиге состоялся в 2006 году в составе «Астаны», и сразу же футболист стал чемпионом Казахстана. Всего в столичной команде Кенжисариев выиграл 58 матчей, забил 8 голов.
Затем он перешёл в «Актобе» в 2008 году, и сыграл за западно-казахстанцев 92 матча, забил 14 мячей.
Является 3-х кратным чемпионом Казахстана, серебряным призером, обладателем кубка Казахстана, 2-х кратным обладателем Суперкубка Казахстана. Рекордсмен по сыгранным матчам в Лиге Чемпионов за казахстанские клубы (13 матчей). Также в биографии футболиста имеется бронзовая медаль чемпионата Азии по футзалу, в составе сборной Кыргызстана.
sports.kz